اسس قسم التربة و المياه عام 2004 حيث يهتم بتهيئة كادر علمي متخصص في اختصاص التربة والمياه والمساهمة في التخطيط و الإشراف على تنفيذ مشاريع البحوث المتعلقة في مجالات إدارة التربة من حيث الاستصلاح وتحديد نوعيات المياه واستخداماتها والقيام بالدراسات الخاصة بتحديد طبيعة الأراضي واستخداماتها المختلفة.